Das Antivirus-Modul vereint eine Reihe von Features, die verhindern, dass ungewollte oder potenziell gefährliche Dateien in das Netzwerk gelangen. Diese Features arbeiten auf unterschiedliche Weise, wie etwa das Prüfen der Dateigröße, des Namens, des Dateityps, oder des Vorhandenseins eines Virus oder einer Grayware Signatur. Dabei haben alle Antivirus-Mechanismen gleichzeitig Zugriff auf den Datenverkehr, wodurch sichergestellt ist, dass viele Operationen nahezu gleichzeitig erfolgen können. Dies erhöht die Performance der Antivirus-Engine erheblich.

• High Peformance AntiVirus: Fortinets optimierte Anti-Virus-Technologie verwendet eine Kombination aus Signatur- und heuristischen Detektionsmodulen und bietet so vielschichtigen Echtzeitschutz gegen zahlreiche Angriffsformen. Extrem hohe System-Performance wird durch die Verwendung des integrierten FortiASIC Content-Prozessors (CP) zusammen mit Fortinets patentierter Technologie, bekannt unter der Bezeichnung CPRL oder Content Pattern Recognition Language, erreicht, die dem beschleunigten Scannen von Virusdateien und der Heuristik/Anomalie- Erkennung dienen.
• AntiVirus Techniken: Abhängig vom erforderlichen Schutzniveau können unterschiedliche Instanzen aktiviert werden, die eingehende Daten auf Malware untersuchen. Dabei wird unterschieden zwischen Pattern Scan, Grayware Scan und einer heuristischen Analyse. Während die ersten beiden Verfahren auf bekannte Virus-Definitionen untersuchen, ist es möglich, mit Letzterer auch Mutationen bekannter Viren oder gänzlich neue Viren-Signaturen zu erkennen.
• Echtzeit Updates: Die Effizienz einer Antivirus-Lösung wird nicht nur an ihrem Durchsatz oder an der Erkennungsrate, sondern auch an der Geschwindigkeit, in der Signatur-Updates eintreffen, gemessen. Über das FortiGuard Distribution Network (FDN) werden diese Informationen kontinuierlich aktualisiert und in Echtzeit bereitgestellt. Dieser Vorgang erfolgt automatisch und erfordert keinen Eingriff des Administrators. Im Vergleich rangiert die Fortinet AV-Engine kontinuierlich unter den Top5 AntiVirus-Anbietern.